تشخیص باکتری های اشریشیا کلی، شیگلا دیسانتری و سالمونلا انتریکا با استفاده از آنالیز ژن ۲۳s rdna

Authors

میثم سرشار

کارشناس ارشد، مرکز تحقیقات بیولوژی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه ا... (عج)، تهران، ایران رضا رنجبر

دانشیار، مرکز تحقیقات بیولوژی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه ا... (عج)، تهران، ایران نادر شاهرخی

استادیار، بخش بیولوژی مولکولی، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران نورخدا صادقی فرد

دانشیار، مرکز تحقیقات میکروب شناسی بالینی، دانشگاه علوم پزشکی ایلام، ایلام، ایران احمد حسنی

abstract

مقدمه: ژن های dna ریبوزومی با داشتن ویژگی های منحصر به فرد همچون حضور در تمامی سلول های میکروارگانیسم ها، وجود مقادیر بالایی از این ژن ها در سلول و همچنین وجود نواحی محافظت شده یک کاندیدای مناسب جهت شناسایی طیف بالایی از میکروارگانیسم ها می باشند. هدف از این مطالعه، بررسی توالی محافظت شده و اختصاصی ژن 23s rdna به عنوان یک هدف dna در افتراق و غربالگری باکتری های اشریشیا کلی، شیگلا دیسانتری و سالمونلا انتریکا بود. روش ها: سویه های باکتریایی اشریشیا کلی، شیگلا دیسانتری و سالمونلا انتریکا از کلکسیون کشت میکروبی انستیتو پاستور ایران تهیه گردید. استخراج dna از سویه های مورد نظر با استفاده از روش جوشاندن صورت گرفت. پس از بررسی منابع و اطلاعات موجود در بانک ژنی، ترادفی از نواحی محافظت شده ی ژن 23s rdna و نواحی اختصاصی درون ژنی آن با توجه به هم ردیفی توالی ها، در نرم افزار alignx از مجموعه ی نرم افزار vector nti انتخاب شد و pcr (polymerase chain reaction) انجام گردید. یافته ها: نتایج حاصل از هم ردیفی قطعه ی اختصاصی ژن 23s rdna در هر یک از باکتری های مورد بررسی بیانگر وجود قطعه ی ژنی به اندازه ی حدود 880 جفت باز در تمامی باکتری های مورد مطالعه بود. پروب های اختصاصی طراحی شده در هر یک از باکتری های اشریشیا کلی، سالمونلا انتریکا و شیگلا دیسانتری وجود باندهای 226، 444 و 776 جفت بازی را نشان داد. نتیجه گیری: نتایج به دست آمده در این مطالعه نشان داد که توالی 23s rdna انتخاب شده در این پژوهش با توجه به محصولات به دست آمده ی حاصل از تکثیر آن، ناحیه ای مناسب و کارامد جهت افتراق و غربالگری سویه های باکتریایی اشریشیا کلی، شیگلا دیسانتری و سالمونلا انتریکا می باشد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

تمایز اشریشیا کلی و شیگلا از سایر انتروباکتریاسه ها با استفاده از تکثیر ژن lamB

سابقه و هدف: وجود جلای فلزی و تخمیر لاکتوز برای شناسایی و تمایز اشریشیا کلی از سایر انتروباکتریاسه‌ها سال‌هاست که در آزمایشگاه‌ها مورد استفاده قرار می گیرد. اما این روش‌ها اشکالاتی را نیز در تشخیص دقیق اشریشیا کلی به همراه دارد. در این مطالعه برای اولین بار در ایران با استفاده از تکنیک PCR به بررسی ژن lamB به منظور تمایز اشریشیا کلی و شی...

full text

تمایز اشریشیا کلی و شیگلا از سایر انتروباکتریاسه ها با استفاده از تکثیر ژن lamB

سابقه و هدف: وجود جلای فلزی و تخمیر لاکتوز برای شناسایی و تمایز اشریشیا کلی از سایر انتروباکتریاسه‌ها سال‌هاست که در آزمایشگاه‌ها مورد استفاده قرار می گیرد. اما این روش‌ها اشکالاتی را نیز در تشخیص دقیق اشریشیا کلی به همراه دارد. در این مطالعه برای اولین بار در ایران با استفاده از تکنیک PCR به بررسی ژن lamB به منظور تمایز اشریشیا کلی و شی...

full text

تشخیص باکتری های اشریشیا کلی و شیگلا با استفاده از تکثیر همدمای حلقوی dna

اشریشیا کلی انتروهموراژیک و شیگلا باسیل های گرم منفی متعلق به خانواده انتروباکتریاسه هستند که نگرانی عمومی غالب در کشورهای توسعه یافته و کشورهای در حال توسعه می باشند. به علت اینکه دز آلوده کنندگی در این باکتری ها پایین است، نقش روش های تشخیصی در این زمینه اهمیت یافته است. برای تشخیص این باکتری ها روش های تشخیصی مرسوم مانند کشت آن ها و تست های بیوشیمیایی استفاده می-شود که روش های پیچیده، پر زحم...

ارزیابی تکنولوژی ریزآرایه های الیگونوکلئوتیدی در تشخیص باکتری های پاتوژن منتقله از طریق غذا

سابقه و هدف: روش های سنتی در تشخیص باکتری های پاتوژن منتقله از طریق غذا بسیار وقت گیر و زمانبر می باشند، بنابراین استفاده از روش های دقیق و قابل اطمینان در تشخیص پاتوژن های میکروبی مورد نیاز است. هدف از این پژوهش طراحی پرایمرهای یونیورسال برای تکثیر ژن 23S rDNA و هیبریدیزاسیون ریز آرایه های الیگونوکلئوتیدی به منظور ارزیابی کارایی و عملکرد توالی 23S rDNA در تشخیص باکتر...

full text

ارزیابی تکنولوژی ریزآرایه های الیگونوکلئوتیدی در تشخیص باکتری های پاتوژن منتقله از طریق غذا

سابقه و هدف: روش های سنتی در تشخیص باکتری های پاتوژن منتقله از طریق غذا بسیار وقت گیر و زمانبر می باشند، بنابراین استفاده از روش های دقیق و قابل اطمینان در تشخیص پاتوژن های میکروبی مورد نیاز است. هدف از این پژوهش طراحی پرایمرهای یونیورسال برای تکثیر ژن 23S rDNA و هیبریدیزاسیون ریز آرایه های الیگونوکلئوتیدی به منظور ارزیابی کارایی و عملکرد توالی 23S rDNA در تشخیص باکتر...

full text

تمایز اشریشیا کلی و شیگلا از سایر انتروباکتریاسه ها با استفاده از تکثیر ژن lamb

سابقه و هدف: وجود جلای فلزی و تخمیر لاکتوز برای شناسایی و تمایز اشریشیا کلی از سایر انتروباکتریاسه ها سال هاست که در آزمایشگاه ها مورد استفاده قرار می گیرد. اما این روش ها اشکالاتی را نیز در تشخیص دقیق اشریشیا کلی به همراه دارد. در این مطالعه برای اولین بار در ایران با استفاده از تکنیک pcr به بررسی ژن lamb به منظور تمایز اشریشیا کلی و شیگلا از سایر اعضای انتروباکتریاسه جدا شده از نمونه های بالی...

full text

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
مجله دانشکده پزشکی اصفهان

جلد ۳۰، شماره ۲۱۹، صفحات ۲۳۳۳-۲۳۴۳

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023